Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NESP48681 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NESP48681 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NESP48681 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NESP48681 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NESP48681 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms