Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ME1P48163 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME1P48163 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME1P48163 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms