Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UTRNP46939 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UTRNP46939 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms