Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GGCXP38435 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms