Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LTBRP36941 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBRP36941 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBRP36941 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBRP36941 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBRP36941 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBRP36941 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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LTBRP36941 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBRP36941 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBRP36941 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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LTBRP36941 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTBRP36941 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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LTBRP36941 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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LTBRP36941 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LTBRP36941 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBRP36941 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LTBRP36941 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBRP36941 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBRP36941 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBRP36941 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBRP36941 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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