Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP1P29466 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms