Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
IL3RAP26951 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms