Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms