Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GLI3P10071 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI3P10071 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI3P10071 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms