Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NEFLP07196 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEFLP07196 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEFLP07196 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEFLP07196 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEFLP07196 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEFLP07196 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEFLP07196 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEFLP07196 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEFLP07196 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NEFLP07196 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEFLP07196 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEFLP07196 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEFLP07196 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEFLP07196 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms