Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F13BP05160 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms