Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSI1O43347 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSI1O43347 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSI1O43347 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSI1O43347 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MSI1O43347 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSI1O43347 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MSI1O43347 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSI1O43347 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MSI1O43347 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MSI1O43347 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSI1O43347 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSI1O43347 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MSI1O43347 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MSI1O43347 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MSI1O43347 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSI1O43347 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSI1O43347 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSI1O43347 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MSI1O43347 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MSI1O43347 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSI1O43347 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MSI1O43347 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MSI1O43347 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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