Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms