Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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