Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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