Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM161AQ9NX61 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM161AQ9NX61 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM161AQ9NX61 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM161AQ9NX61 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM161AQ9NX61 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM161AQ9NX61 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM161AQ9NX61 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms