Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms