Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP58Q9BVL2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms