Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TXNDC17Q9BRA2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms