Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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