Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RASSF3Q86WH2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms