Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC84Q86UT8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC84Q86UT8 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms