Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RUFY3Q7L099 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms