Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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USP43Q70EL4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP43Q70EL4 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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