Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF2Q5BJF6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms