Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF239Q16600 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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