Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 IFT80-201ENST00000326448 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CSPG4P10-201ENST00000456932 4817 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZMYND11-201ENST00000309776 4228 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LRRC55-201ENST00000497933 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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