Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ACSBG2-202ENST00000586696 2739 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RAB7B-202ENST00000617991 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZMYND11-201ENST00000309776 4228 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MAGED1-202ENST00000375695 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZWINT-203ENST00000373944 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SLAMF7-205ENST00000444090 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SLC2A4-201ENST00000317370 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CACNG4-201ENST00000262138 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TIAM2-206ENST00000456877 3275 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GOLGA8DP-201ENST00000314246 2786 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MASP2-201ENST00000400897 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms