Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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