Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms