Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CREMQ03060 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREMQ03060 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREMQ03060 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREMQ03060 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CREMQ03060 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREMQ03060 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREMQ03060 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREMQ03060 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREMQ03060 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CREMQ03060 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms