Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
NHLH2Q02577 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms