Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NFASC-202ENST00000360049 10120 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NFASC-225ENST00000539706 10135 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 COL9A1-202ENST00000357250 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms