Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPHB1P54762 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms