Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNQ1P51787 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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