Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANGAP1P46060 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RANGAP1P46060 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms