Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPB2P35606 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPB2P35606 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms