Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPREP23469 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPREP23469 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPREP23469 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPREP23469 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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