Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCC9O60706 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms