Protein–RNA interactions for Protein: O00488

ZNF593, Zinc finger protein 593, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF593O00488 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZNF593O00488 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms