Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms