Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP15Q9Y4E8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP15Q9Y4E8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms