Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REREQ9P2R6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REREQ9P2R6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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