Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNKQ9P0W0 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms