Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TBCCD1Q9NVR7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms