Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CIPCQ9C0C6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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