Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKD2Q9BZL6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms