Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GNLY-201ENST00000263863 846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL121892.1-201ENST00000422574 833 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000346.2-201ENST00000430707 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SNORA74.2-201ENST00000516496 180 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 OR52P2P-201ENST00000527287 955 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms