Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NIFKQ9BYG3 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms