Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms